موضوع دانشگاه سبز و حفظ محیط زیست به عنوان یک محور مشخص، مورد توجه مدیران و برنامه‌ریزان دانشگاه گنبدکاووس قرار داشته و اقدامات عملی و شاخص‌های کلیدی عملکرد جهت دستیابی به جایگاه شایسته دانشگاه به عنوان یک نهاد پیشگام اجتماعی در زمینه توسعه پایدار آورده شده است. همچنین پس از ابلاغ دستورالعمل مدیریت سبز (مدیریت مصرف انرژی، مواد و حفظ محیط زیست) در دانشگاه‌ها، مراکز پژوهشی و پارک‌های علم و فناوری از سوی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، شورای راهبری مدیریت سبز و کمیته‌های اصلاح الگوی مصرف و فرهنگی و آموزشی در دانشگاه گنبدکاووس شکل گرفته است.
اقدامات اجرایی مدیریت سبز در این دستورالعمل در حوزه‌های نه گانه کنترل سیستم روشنایی، کنترل سیستم‌های حرارتی، برودتی و تهویه مطبوع، کنترل تجهیزات اداری و نحوه استفاده از آن‌ها، مدیریت مصرف آب، مدیریت پسماند، مدیریت میزان مصرف کاغذ و اقلام مصرفی، استفاده از فناوری‌های پاک و انرژی‌های تجدید پذیر، فرهنگ سازی و توسعه مدیریت انرژی و حمل و نقل مطرح شده‌اند که اجرایی شدن اقدامات اجرایی مرتبط از طریق کمیته‌ها و شورای راهبری و دفتر مدیریت سبز دانشگاه مورد پیگیری قرار گرفته است.
با هدف ارتقای دانش محیط زیستی و فرهنگ سازی در سطح دانشگاه و به منظور کمک به موفقیت اجرای راهبرد دانشگاه سبز و حفظ محیط زیست در دانشگاه و اجرایی نمودن دستورالعمل مدیریت سبز، گنجاندن مسائل محیط زیستی در وب سایت‌ها و نشریه‌های دانشگاه، در دستورکار شورای راهبری مدیریت سبز قرار گرفته است.
